Houllier se confrunta de mulţi ani cu probleme cardiace, care l-au şi obligat, de altfel, să pună capăt carierei sale de antrenor în urmă cu un deceniu.
Fost secund al lui Henri Michel şi Michel Platini la reprezentativa Franţei, Houlier a preluat conducerea naţionalei „cocoşului galic” în vara anului 1992, aventura sa încheindu-se şaisprezece luni mai târziu, după eşecul suferit pe teren propriu de Franţa în faţa Bulgariei (1-2), sinonim cu ratarea calificării la Cupa Mondială din 1994, găzduită de Statele Unite.
Înainte de a activa la selecţionata Franţei, Houllier a pregătit formaţia Paris Saint-Germain, cu care a cucerit titlul naţional în 1986. Între 1998 şi 2004, tehnicianul francez a pregătit-o pe FC Liverpool, alături de care a avut un an 2001 excepţional, pe parcursul căruia a cucerit patru trofee, între care Cupa Angliei şi Cupa UEFA. El a activat apoi la Olympique Lyon, obţinând două titluri de campion al Franţei, în 2006 şi 2007.
Ultima echipă antrenată de Gerard Houlier a fost Aston Villa, în sezonul 2010/1011.