Pe data de 12 iunie Federatia Romana de Fotbal a pus in aplicare decizia Tribunalului de Arbitraj Sportiv din litigiul SCS FC Politehnica Timisoara SA si FCU Politehnica Timisoara&Invest SA. Astfel, clubul patronat de Marian Iancu a fost obligat ca pana pe data de 27 iunie 2007 sa plateasca despagubiri de aproximativ 290.000 de euro si sa revina la denumirea anterioara, adica Politehnica AEK Timisoara, sau sa-si ia un nume care sa nu se confunde cu SCS FC Politehnica Timisoara SA.
Oficialii echipei patronate pana la data de 26 februarie 2007 de Claudio Zambon au considerat ca FRF nu a pus corect in aplicarea deciziei TAS din 5 decembrie 2006, astfel ca s-au adresat din nou forului fotbalistic international. Din punctul lor de vedere, FRF nu a pus in aplicare decat punctul 4 al hotararii, cel care se refera la plata de catre FCU Politehnica Timisoara&Invest a 90.000 de euro pentru folosirea numelui, culorilor, imnului, logo-ului si istoriei SCS FC Politehnica Timisoara SA in perioada 13 iunie 2006-4 decembrie 2006. Printre nemultumirile SCS FC Politehnica Timisoara SA se regasesc prezenta lui Gheorghe Chivorchian la sedinta Comitetului Executiv al FRF din 12 iunie, dar si faptul ca CEx a stabilit ca suma pe care FCU Politehnica Timisoara SA trebuie s-o achite ca daune pentru folosirea numelui, istoriei, culorilor si imnului, in fiecare meci disputat de banateni in perioada 31 ianuarie 2005-12 iunie 2006, sa fie doar de 2.000 de euro.
Memoriul facut de conducerea echipei care a retrogradat in a patra liga la sfarsitul sezonului a fost analizat de catre comisiile de disciplina si juridica ale FIFA, considerand ca FRF nu a pus in aplicare corect decizia TAS. Astfel, FIFA ia in calcul convocarea oficialilor FRF la comisia de disciplina si sanctionarea forului roman.
